Когда часть Российских экспонатов получили признание на Международной гигиенической выставке в Брюсселе и родилась идея создания музея-гигиены. В 1893 и 1913 годах были проведены две крупные Всероссийские гигиенические выставки. Экспонаты гигиенической выставки 1913 года стали основой стационарной выставки-музея здравоохранения, решение о необходимосьи создания которого, было принято группой ученых-медиков в 1918 году. 21 февраля 1919 года состоялось открытие. Для музея Комиссариат здравоохоанения Союза Северной области предоставил особняк, принадлежавший графу И.И. Шувалову. Музей имел цель популяризовать знания среди населения путем организации постоянной и передвижной выставки, а также путем распространения медицинской литературы. Заинтересованность в санитарном просвещении и ряда проблем охраны здоровья обусловили быстрое расширение выставки-музея здравоохранения.
Техническое переоснащение музея, происходившее в в период 1928-1938гг., позволило ему достигнуть своего расцвета и стать широко известным. В конце 1980-годов проведены ремонтные работы помещений. Реставрационные работы музейных экспонатов создали обновленный интерьер и повысили доступность иллюстративного материала. Музей гигиены, являясь структурным подразделением ГУЗ "Городской центр медицинской профилактики", реализует одно из приоритетных направлений деятельности системы здравоохранения; ознакомление с анатомо-физиологическими особенностями человека; пропаганды дрового образа жизни; информирования о состоянии экологической ситуации; профилактика ВИЧ СПИДа , вредных привычек (наркомания, алкоголизм, курение).Школьникам часто организуют экскурсии в этот музей.
